Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGS1Q96RS0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TGS1Q96RS0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TGS1Q96RS0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TGS1Q96RS0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGS1Q96RS0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGS1Q96RS0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TGS1Q96RS0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
TGS1Q96RS0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms