Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JSRP1Q96MG2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
JSRP1Q96MG2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
JSRP1Q96MG2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
JSRP1Q96MG2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms