Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW4

PRIMPOL, DNA-directed primase/polymerase protein, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIMPOLQ96LW4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PRIMPOLQ96LW4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRIMPOLQ96LW4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRIMPOLQ96LW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRIMPOLQ96LW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIMPOLQ96LW4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIMPOLQ96LW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIMPOLQ96LW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRIMPOLQ96LW4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIMPOLQ96LW4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIMPOLQ96LW4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRIMPOLQ96LW4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIMPOLQ96LW4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRIMPOLQ96LW4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms