Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNX27Q96L92 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNX27Q96L92 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SNX27Q96L92 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SNX27Q96L92 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms