Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A3Q96HJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MS4A3Q96HJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MS4A3Q96HJ5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MS4A3Q96HJ5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms