Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF31Q96EP0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF31Q96EP0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RNF31Q96EP0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RNF31Q96EP0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms