Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH8

NEURL3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL3Q96EH8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEURL3Q96EH8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NEURL3Q96EH8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NEURL3Q96EH8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NEURL3Q96EH8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms