Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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TRIM63Q969Q1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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TRIM63Q969Q1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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TRIM63Q969Q1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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TRIM63Q969Q1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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TRIM63Q969Q1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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