Protein–RNA interactions for Protein: Q92832

NELL1, Protein kinase C-binding protein NELL1, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELL1Q92832 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NELL1Q92832 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NELL1Q92832 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NELL1Q92832 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NELL1Q92832 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms