Protein–RNA interactions for Protein: Q92786

PROX1, Prospero homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX1Q92786 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PROX1Q92786 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PROX1Q92786 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROX1Q92786 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROX1Q92786 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms