Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COPS9Q8WXC6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
COPS9Q8WXC6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
COPS9Q8WXC6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
COPS9Q8WXC6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.7 ms