Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VANGL1Q8TAA9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VANGL1Q8TAA9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VANGL1Q8TAA9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VANGL1Q8TAA9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms