Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NEDD1Q8NHV4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEDD1Q8NHV4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEDD1Q8NHV4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NEDD1Q8NHV4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NEDD1Q8NHV4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
NEDD1Q8NHV4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NEDD1Q8NHV4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
NEDD1Q8NHV4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
NEDD1Q8NHV4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms