Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HJURPQ8NCD3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
HJURPQ8NCD3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HJURPQ8NCD3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HJURPQ8NCD3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms