Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC42

RNF149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF149Q8NC42 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF149Q8NC42 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RNF149Q8NC42 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNF149Q8NC42 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF149Q8NC42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF149Q8NC42 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms