Protein–RNA interactions for Protein: Q8N268

C20orf197, Uncharacterized protein C20orf197, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf197Q8N268 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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C20orf197Q8N268 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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C20orf197Q8N268 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
C20orf197Q8N268 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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C20orf197Q8N268 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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C20orf197Q8N268 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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C20orf197Q8N268 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
C20orf197Q8N268 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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