Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G4

LRRC47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC47Q8N1G4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LRRC47Q8N1G4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
LRRC47Q8N1G4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LRRC47Q8N1G4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LRRC47Q8N1G4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRRC47Q8N1G4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC47Q8N1G4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRRC47Q8N1G4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC47Q8N1G4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC47Q8N1G4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRRC47Q8N1G4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230 ms