Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI2

RHOT1, Mitochondrial Rho GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT1Q8IXI2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RHOT1Q8IXI2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RHOT1Q8IXI2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RHOT1Q8IXI2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOT1Q8IXI2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOT1Q8IXI2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms