Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUK5

PLXDC1, Plexin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXDC1Q8IUK5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXDC1Q8IUK5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXDC1Q8IUK5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXDC1Q8IUK5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXDC1Q8IUK5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PLXDC1Q8IUK5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXDC1Q8IUK5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXDC1Q8IUK5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLXDC1Q8IUK5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PLXDC1Q8IUK5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms