Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
NME9Q86XW9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NME9Q86XW9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NME9Q86XW9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
NME9Q86XW9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NME9Q86XW9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NME9Q86XW9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms