Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LCA5Q86VQ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LCA5Q86VQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LCA5Q86VQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms