Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHMP1BQ7LBR1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP1BQ7LBR1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP1BQ7LBR1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP1BQ7LBR1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.5 ms