Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP43Q70EL4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP43Q70EL4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP43Q70EL4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP43Q70EL4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.7 ms