Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTI6

RFLNA, Refilin-A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFLNAQ6ZTI6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RFLNAQ6ZTI6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFLNAQ6ZTI6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RFLNAQ6ZTI6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFLNAQ6ZTI6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.6 ms