Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GDPD4Q6W3E5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GDPD4Q6W3E5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GDPD4Q6W3E5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GDPD4Q6W3E5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms