Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWH4

FAM198B, Protein FAM198B, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM198BQ6UWH4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM198BQ6UWH4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FAM198BQ6UWH4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM198BQ6UWH4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM198BQ6UWH4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FAM198BQ6UWH4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM198BQ6UWH4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms