Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEK5Q6P3R8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEK5Q6P3R8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NEK5Q6P3R8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NEK5Q6P3R8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms