Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
EDC4Q6P2E9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
EDC4Q6P2E9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
EDC4Q6P2E9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
EDC4Q6P2E9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
EDC4Q6P2E9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
EDC4Q6P2E9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms