Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC18B1Q6NT16 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18B1Q6NT16 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC18B1Q6NT16 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms