Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROX2Q3B8N5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PROX2Q3B8N5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PROX2Q3B8N5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PROX2Q3B8N5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms