Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTC1Q2NKJ3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTC1Q2NKJ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CTC1Q2NKJ3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTC1Q2NKJ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms