Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCK2Q16822 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCK2Q16822 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCK2Q16822 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK2Q16822 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCK2Q16822 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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