Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VAMP3Q15836 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VAMP3Q15836 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VAMP3Q15836 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VAMP3Q15836 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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