Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.7
NCOA1Q15788 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.69
NCOA1Q15788 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
NCOA1Q15788 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NCOA1Q15788 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
NCOA1Q15788 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
NCOA1Q15788 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
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