Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TAF11Q15544 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TAF11Q15544 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TAF11Q15544 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TAF11Q15544 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms