Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RRP1BQ14684 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RRP1BQ14684 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1BQ14684 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP1BQ14684 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1BQ14684 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms