Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
TCOF1Q13428 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
TCOF1Q13428 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC38.56■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.54■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
TCOF1Q13428 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC38.51■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.51■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
TCOF1Q13428 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TCOF1Q13428 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TCOF1Q13428 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.72
TCOF1Q13428 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TCOF1Q13428 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
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