Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TRAF1Q13077 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TRAF1Q13077 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
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TRAF1Q13077 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
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TRAF1Q13077 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAF1Q13077 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
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TRAF1Q13077 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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TRAF1Q13077 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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TRAF1Q13077 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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TRAF1Q13077 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
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TRAF1Q13077 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRAF1Q13077 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRAF1Q13077 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
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