Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NFIAQ12857 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NFIAQ12857 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NFIAQ12857 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NFIAQ12857 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
NFIAQ12857 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms