Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 HXT13YEL069C 1695 nt6.77□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 YCR099CYCR099C 468 nt6.76□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 STS1YIR011C 960 nt6.76□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 RSM23YGL129C 1353 nt6.76□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 LRO1YNR008W 1986 nt6.76□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 YGL081WYGL081W 963 nt6.75□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 RCF1YML030W 480 nt6.75□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 YNR068CYNR068C 819 nt6.75□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 YMC2YBR104W 990 nt6.75□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt6.74□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt6.74□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 TRR2YHR106W 1029 nt6.74□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 PRS4YBL068W 981 nt6.74□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 ODC1YPL134C 933 nt6.74□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 LEU4YNL104C 1860 nt6.74□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.74□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.74□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.74□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 PRP2YNR011C 2631 nt6.73□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 ADE17YMR120C 1779 nt6.73□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 YNL165WYNL165W 1221 nt6.73□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 URE2YNL229C 1065 nt6.73□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 MPH3YJR160C 1809 nt6.73□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 TES1YJR019C 1050 nt6.72□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 DPH5YLR172C 903 nt6.72□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 CDC3YLR314C 1563 nt6.72□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 AGP3YFL055W 1677 nt6.71□□□□□ -1.33
MSL5Q12186 MGM101YJR144W 810 nt6.71□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 YBL081WYBL081W 1107 nt6.71□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 HAL5YJL165C 2568 nt6.71□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 YER152CYER152C 1332 nt6.71□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 HRB1YNL004W 1365 nt6.7□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 CDC13YDL220C 2775 nt6.7□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 TOP3YLR234W 1971 nt6.7□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 ARO3YDR035W 1113 nt6.7□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 AST1YBL069W 1290 nt6.7□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 TIF3YPR163C 1311 nt6.7□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 CBK1YNL161W 2271 nt6.7□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 BIO3YNR058W 1443 nt6.69□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 RRP43YCR035C 1185 nt6.69□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 MDM35YKL053C-A 261 nt6.69□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 YLR184WYLR184W 348 nt6.69□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 KDX1YKL161C 1302 nt6.69□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 TOS2YGR221C 1869 nt6.68□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 HSM3YBR272C 1443 nt6.68□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 CPR2YHR057C 618 nt6.68□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 DUS3YLR401C 2007 nt6.67□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 NBA1YOL070C 1506 nt6.67□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 PIC2YER053C 903 nt6.67□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 AIM34YMR003W 597 nt6.67□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 SUN4YNL066W 1263 nt6.67□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 HOS2YGL194C 1359 nt6.67□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 YNL040WYNL040W 1371 nt6.67□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 APM1YPL259C 1428 nt6.67□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 YRF1-2YER190W 5046 nt6.66□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 AVO2YMR068W 1281 nt6.66□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 STE3YKL178C 1413 nt6.66□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 PSA1YDL055C 1086 nt6.65□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 INH1YDL181W 258 nt6.65□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 YHP1YDR451C 1062 nt6.65□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 BIM1YER016W 1035 nt6.65□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 YIP4YGL198W 708 nt6.65□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 SML1YML058W 315 nt6.65□□□□□ -1.34
MSL5Q12186 WSC3YOL105C 1671 nt6.65□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 snR86snR86 1004 nt6.64□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 YGR137WYGR137W 375 nt6.64□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 LDB7YBL006C 543 nt6.64□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 MIM1YOL026C 342 nt6.64□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 MOD5YOR274W 1287 nt6.64□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 ERG10YPL028W 1197 nt6.64□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 CYS4YGR155W 1524 nt6.64□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 OSM1YJR051W 1506 nt6.63□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 YMR147WYMR147W 672 nt6.63□□□□□ -1.35 RIP-Chip
MSL5Q12186 YNL295WYNL295W 1575 nt6.63□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 ATO2YNR002C 849 nt6.63□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 SCO2YBR024W 906 nt6.63□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 COX16YJL003W 357 nt6.62□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 PRY2YKR013W 990 nt6.62□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 DIP5YPL265W 1827 nt6.62□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 EEB1YPL095C 1371 nt6.61□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 OPI7YDR360W 435 nt6.61□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 PIL1YGR086C 1020 nt6.61□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 INP54YOL065C 1155 nt6.61□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 MNN9YPL050C 1188 nt6.61□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 YPL136WYPL136W 369 nt6.61□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 YEL074WYEL074W 339 nt6.6□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 AIM20YIL158W 615 nt6.6□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 FCY22YER060W-A 1593 nt6.6□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 AAT1YKL106W 1356 nt6.59□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 BUD31YCR063W 474 nt6.59□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 LSM12YHR121W 564 nt6.59□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 QRI5YLR204W 336 nt6.59□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 AIM41YOR215C 558 nt6.59□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 snR30snR30 606 nt6.59□□□□□ -1.35
MSL5Q12186 SPS1YDR523C 1473 nt6.59□□□□□ -1.36
MSL5Q12186 NPP2YEL016C 1482 nt6.59□□□□□ -1.36
MSL5Q12186 ICE2YIL090W 1476 nt6.59□□□□□ -1.36
MSL5Q12186 BNA3YJL060W 1335 nt6.58□□□□□ -1.36
MSL5Q12186 HBS1YKR084C 1836 nt6.58□□□□□ -1.36
MSL5Q12186 YGL118CYGL118C 438 nt6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.8 ms