Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDE4CQ08493 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDE4CQ08493 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDE4CQ08493 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDE4CQ08493 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms