Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LRP1Q07954 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRP1Q07954 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms