Protein–RNA interactions for Protein: Q04477

SPC24, Kinetochore protein SPC24, yeastyeast

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPC24Q04477 ERG24YNL280C 1317 nt7.46□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 YJL045WYJL045W 1905 nt7.45□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 YGR210CYGR210C 1236 nt7.45□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 YDR306CYDR306C 1437 nt7.44□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 EFM1YHL039W 1758 nt7.44□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.44□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 EDC3YEL015W 1656 nt7.44□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 ICL2YPR006C 1728 nt7.44□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 BAP3YDR046C 1815 nt7.43□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 MEU1YLR017W 1014 nt7.43□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 STE3YKL178C 1413 nt7.42□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 OPI1YHL020C 1215 nt7.41□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 STP3YLR375W 1032 nt7.41□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 YMR206WYMR206W 942 nt7.41□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 SER2YGR208W 930 nt7.4□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 RPS6AYPL090C 711 nt7.4□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 YPL108WYPL108W 507 nt7.4□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 RPS6BYBR181C 711 nt7.4□□□□□ -1.22
SPC24Q04477 NUP84YDL116W 2181 nt7.4□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.39□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.39□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.39□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.39□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.39□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 ARC35YNR035C 1029 nt7.39□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 CYB2YML054C 1776 nt7.38□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 YNL295WYNL295W 1575 nt7.38□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 YCR025CYCR025C 411 nt7.38□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 YLR349WYLR349W 507 nt7.38□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 MCH2YKL221W 1422 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 MTR3YGR158C 753 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 RRN10YBL025W 438 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 PGC1YPL206C 966 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 HTS1YPR033C 1641 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 BDS1YOL164W 1941 nt7.37□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 CMK2YOL016C 1344 nt7.36□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 GET2YER083C 858 nt7.36□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 NTG1YAL015C 1200 nt7.36□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 INP54YOL065C 1155 nt7.36□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 YPR084WYPR084W 1371 nt7.35□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 SNT309YPR101W 528 nt7.35□□□□□ -1.23
SPC24Q04477 SUN4YNL066W 1263 nt7.33□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 SMK1YPR054W 1167 nt7.33□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 FCY1YPR062W 477 nt7.33□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 CDC7YDL017W 1524 nt7.32□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 RDR1YOR380W 1641 nt7.32□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 AGP2YBR132C 1791 nt7.32□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 ATP2YJR121W 1536 nt7.32□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 PET18YCR020C 648 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 RRP43YCR035C 1185 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 ERS1YCR075C 783 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 AMN1YBR158W 1650 nt7.31□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 RPL2BYIL018W 765 nt7.3□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 HEL1YKR017C 1656 nt7.3□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 YER156CYER156C 1017 nt7.29□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 YPT10YBR264C 600 nt7.29□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 YBR241CYBR241C 1467 nt7.28□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 SMC5YOL034W 3282 nt7.28□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 MHP1YJL042W 4197 nt7.27□□□□□ -1.24
SPC24Q04477 GSH1YJL101C 2037 nt7.27□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 PHO85YPL031C 918 nt7.27□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 YCR061WYCR061W 1896 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 ADH6YMR318C 1083 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 YLL066CYLL066C 3618 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 TAH11YJR046W 1815 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 CEM1YER061C 1329 nt7.26□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 SPS1YDR523C 1473 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 YIL168WYIL168W 384 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 PAU15YIR041W 375 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 YMR074CYMR074C 438 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 OPI11YPR044C 354 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 TDP1YBR223C 1635 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 PGI1YBR196C 1665 nt7.25□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 GPH1YPR160W 2709 nt7.24□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 YAL045CYAL045C 309 nt7.24□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 YBR232CYBR232C 360 nt7.24□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 PSA1YDL055C 1086 nt7.23□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 YPR127WYPR127W 1038 nt7.23□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 IRC5YFR038W 2562 nt7.22□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 MRPL28YDR462W 444 nt7.22□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 GRH1YDR517W 1119 nt7.22□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 DSC3YOR223W 879 nt7.22□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 HBN1YCL026C-B 582 nt7.22□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 CCT3YJL014W 1605 nt7.22□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 PUS7YOR243C 2031 nt7.22□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 VTS1YOR359W 1572 nt7.21□□□□□ -1.25
SPC24Q04477 RSP5YER125W 2430 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 CLN1YMR199W 1641 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 SUF3tG(CCC)D 72 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 CTF8YHR191C 402 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 MIX17YMR002W 471 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 ERG12YMR208W 1332 nt7.2□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 ECM38YLR299W 1983 nt7.19□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 CRN1YLR429W 1956 nt7.19□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 SKY1YMR216C 2229 nt7.19□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.19□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 ERG27YLR100W 1044 nt7.19□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 ACO1YLR304C 2337 nt7.19□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 EMP65YER140W 1671 nt7.19□□□□□ -1.26
SPC24Q04477 DLD1YDL174C 1764 nt7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.3 ms