Protein–RNA interactions for Protein: Q04368

CSI1, Cop9 signalosome-interactor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI1Q04368 CCW12YLR110C 402 nt8.88□□□□□ -0.99
CSI1Q04368 YBL111CYBL111C 2004 nt8.88□□□□□ -0.99
CSI1Q04368 URA8YJR103W 1737 nt8.88□□□□□ -0.99
CSI1Q04368 SNF7YLR025W 723 nt8.87□□□□□ -0.99
CSI1Q04368 PTH2YBL057C 627 nt8.86□□□□□ -0.99
CSI1Q04368 YAH1YPL252C 519 nt8.86□□□□□ -0.99
CSI1Q04368 TPI1YDR050C 747 nt8.85□□□□□ -0.99
CSI1Q04368 PDA1YER178W 1263 nt8.84□□□□□ -0.99
CSI1Q04368 YML122CYML122C 381 nt8.84□□□□□ -0.99
CSI1Q04368 AFG3YER017C 2286 nt8.83□□□□□ -1
CSI1Q04368 TCB1YOR086C 3561 nt8.83□□□□□ -1
CSI1Q04368 DCR2YLR361C 1737 nt8.81□□□□□ -1
CSI1Q04368 YJL213WYJL213W 996 nt8.81□□□□□ -1
CSI1Q04368 COS10YNR075W 1125 nt8.81□□□□□ -1
CSI1Q04368 LAT1YNL071W 1449 nt8.8□□□□□ -1
CSI1Q04368 TRR2YHR106W 1029 nt8.8□□□□□ -1
CSI1Q04368 CST26YBR042C 1194 nt8.8□□□□□ -1
CSI1Q04368 UFD1YGR048W 1086 nt8.79□□□□□ -1
CSI1Q04368 YOX1YML027W 1158 nt8.79□□□□□ -1
CSI1Q04368 YLR030WYLR030W 792 nt8.78□□□□□ -1
CSI1Q04368 RTC2YBR147W 891 nt8.78□□□□□ -1
CSI1Q04368 RDR1YOR380W 1641 nt8.77□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YGL260WYGL260W 231 nt8.77□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YPL264CYPL264C 1062 nt8.77□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 GTB1YDR221W 2109 nt8.76□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 PAM17YKR065C 594 nt8.76□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 PRS4YBL068W 981 nt8.76□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 snR30snR30 606 nt8.76□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 HXT9YJL219W 1704 nt8.76□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 ERG24YNL280C 1317 nt8.75□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 GNA1YFL017C 480 nt8.74□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 ZIM17YNL310C 525 nt8.74□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YOR041CYOR041C 432 nt8.74□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 NAF1YNL124W 1479 nt8.74□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 NFS1YCL017C 1494 nt8.74□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 CIT2YCR005C 1383 nt8.73□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 DMC1YER179W 1005 nt8.73□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YKL147CYKL147C 618 nt8.73□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 RTC4YNL254C 1206 nt8.73□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 TOP3YLR234W 1971 nt8.73□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YER152CYER152C 1332 nt8.73□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YDR327WYDR327W 327 nt8.72□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YPR130CYPR130C 408 nt8.72□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.72□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.72□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.72□□□□□ -1.01
CSI1Q04368 PET117YER058W 324 nt8.7□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 AIM46YHR199C 933 nt8.7□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 YMR074CYMR074C 438 nt8.7□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 LIP5YOR196C 1245 nt8.7□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 DML1YMR211W 1428 nt8.7□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 DPM1YPR183W 804 nt8.69□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 CDC7YDL017W 1524 nt8.69□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 PGI1YBR196C 1665 nt8.69□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 MAL31YBR298C 1845 nt8.68□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 ERG27YLR100W 1044 nt8.68□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 YPQ2YDR352W 954 nt8.67□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 SUF3tG(CCC)D 72 nt8.67□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 URA1YKL216W 945 nt8.67□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 MSS51YLR203C 1311 nt8.67□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 MCP1YOR228C 909 nt8.67□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 YCL049CYCL049C 939 nt8.66□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 CDC23YHR166C 1881 nt8.66□□□□□ -1.02
CSI1Q04368 YLR162WYLR162W 357 nt8.64□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 GET4YOR164C 939 nt8.63□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 PRC1YMR297W 1599 nt8.63□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 PLB2YMR006C 2121 nt8.63□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 TUB1YML085C 1344 nt8.62□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 CIA1YDR267C 993 nt8.62□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 GTS1YGL181W 1191 nt8.62□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 EXG2YDR261C 1689 nt8.62□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 FLC2YAL053W 2352 nt8.62□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 RFC1YOR217W 2586 nt8.62□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 ILV2YMR108W 2064 nt8.61□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 MPE1YKL059C 1326 nt8.61□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 YJL144WYJL144W 315 nt8.61□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 SML1YML058W 315 nt8.61□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 LGE1YPL055C 999 nt8.6□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 AIM34YMR003W 597 nt8.59□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 PUS4YNL292W 1212 nt8.59□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt8.59□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 SPE3YPR069C 882 nt8.59□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 DTR1YBR180W 1719 nt8.59□□□□□ -1.03
CSI1Q04368 YKR018CYKR018C 2178 nt8.58□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 RMD8YFR048W 1989 nt8.58□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 BEM1YBR200W 1656 nt8.58□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 HEM14YER014W 1620 nt8.58□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 YCR049CYCR049C 447 nt8.57□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 SPE4YLR146C 903 nt8.57□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 BRN1YBL097W 2265 nt8.57□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 NUP57YGR119C 1626 nt8.56□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 MPH3YJR160C 1809 nt8.56□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 FCY2YER056C 1602 nt8.55□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 RPL43AYPR043W 279 nt8.55□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 BIO3YNR058W 1443 nt8.54□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 CTA1YDR256C 1548 nt8.54□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 ITR1YDR497C 1755 nt8.54□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 ERR3YMR323W 1314 nt8.54□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 HTZ1YOL012C 405 nt8.53□□□□□ -1.04
CSI1Q04368 PHO85YPL031C 918 nt8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19 ms