Protein–RNA interactions for Protein: Q04062

RPN9, 26S proteasome regulatory subunit RPN9, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN9Q04062 STS1YIR011C 960 nt7.43□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 ATO2YNR002C 849 nt7.43□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 CDC13YDL220C 2775 nt7.42□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 SLM3YDL033C 1254 nt7.42□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 HXT13YEL069C 1695 nt7.41□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 YEL023CYEL023C 2049 nt7.41□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 PSA1YDL055C 1086 nt7.41□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 GET2YER083C 858 nt7.41□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 KAE1YKR038C 1161 nt7.41□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 VPS65YLR322W 315 nt7.41□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 PAB1YER165W 1734 nt7.41□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 OPI1YHL020C 1215 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 YJR142WYJR142W 1029 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 DAL80YKR034W 810 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 ATP10YLR393W 840 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 CAR2YLR438W 1275 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 RCF2YNR018W 675 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 YOR268CYOR268C 399 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 YPC1YBR183W 951 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 SPS1YDR523C 1473 nt7.4□□□□□ -1.22
RPN9Q04062 GUT1YHL032C 2130 nt7.39□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 ERV25YML012W 636 nt7.39□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 MSI1YBR195C 1269 nt7.39□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 BDS1YOL164W 1941 nt7.39□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 MLS1YNL117W 1665 nt7.38□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 MAS2YHR024C 1449 nt7.38□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 HRB1YNL004W 1365 nt7.38□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 PPZ2YDR436W 2133 nt7.38□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 DSC3YOR223W 879 nt7.38□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 YPT10YBR264C 600 nt7.38□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 MGM101YJR144W 810 nt7.37□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 CBK1YNL161W 2271 nt7.37□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 YNL040WYNL040W 1371 nt7.36□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 LEO1YOR123C 1395 nt7.36□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 NMA2YGR010W 1188 nt7.36□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 NCA3YJL116C 1014 nt7.36□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 YLR358CYLR358C 564 nt7.36□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 SNA3YJL151C 402 nt7.34□□□□□ -1.23
RPN9Q04062 YGL081WYGL081W 963 nt7.33□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 PIL1YGR086C 1020 nt7.33□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 PIH1YHR034C 1035 nt7.33□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 CKI1YLR133W 1749 nt7.32□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 OSM1YJR051W 1506 nt7.32□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 TCB1YOR086C 3561 nt7.32□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 DOC1YGL240W 753 nt7.32□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 PRY2YKR013W 990 nt7.32□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 RTC2YBR147W 891 nt7.32□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 ERR3YMR323W 1314 nt7.31□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 ERR1YOR393W 1314 nt7.31□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 ERR2YPL281C 1314 nt7.31□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 YHR131CYHR131C 2553 nt7.3□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 CDC3YLR314C 1563 nt7.3□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 YMR253CYMR253C 1245 nt7.3□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 ATP23YNR020C 813 nt7.3□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 YAH1YPL252C 519 nt7.3□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 FCP1YMR277W 2199 nt7.3□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 YBL113CYBL113C 2379 nt7.3□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 STF1YDL130W-A 261 nt7.29□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 TPI1YDR050C 747 nt7.29□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 ADH6YMR318C 1083 nt7.29□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 BAP3YDR046C 1815 nt7.29□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 HNM1YGL077C 1692 nt7.28□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 HXT9YJL219W 1704 nt7.28□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 SKP1YDR328C 585 nt7.28□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 YJL213WYJL213W 996 nt7.28□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 SPE4YLR146C 903 nt7.28□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 AQR1YNL065W 1761 nt7.28□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 YER152CYER152C 1332 nt7.27□□□□□ -1.24
RPN9Q04062 YJL045WYJL045W 1905 nt7.27□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 MFG1YDL233W 1377 nt7.26□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 GNA1YFL017C 480 nt7.26□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 AFG3YER017C 2286 nt7.26□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 ECM27YJR106W 2178 nt7.26□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 ERG24YNL280C 1317 nt7.26□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 YGL260WYGL260W 231 nt7.25□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 YLR030WYLR030W 792 nt7.24□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 CCW12YLR110C 402 nt7.24□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 PRE5YMR314W 705 nt7.24□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 YPL264CYPL264C 1062 nt7.24□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 DCR2YLR361C 1737 nt7.24□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 YBL111CYBL111C 2004 nt7.23□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 YCR061WYCR061W 1896 nt7.22□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 YDR327WYDR327W 327 nt7.22□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 PTH2YBL057C 627 nt7.22□□□□□ -1.25
RPN9Q04062 PUP2YGR253C 783 nt7.21□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 YML122CYML122C 381 nt7.21□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 MAL31YBR298C 1845 nt7.2□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 YKL147CYKL147C 618 nt7.2□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 YML079WYML079W 606 nt7.2□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 CIT2YCR005C 1383 nt7.2□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 GTS1YGL181W 1191 nt7.19□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 PAM17YKR065C 594 nt7.19□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 RPR1RPR1 369 nt7.19□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 YOR041CYOR041C 432 nt7.19□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 MSS51YLR203C 1311 nt7.19□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 CMK2YOL016C 1344 nt7.19□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 HEL1YKR017C 1656 nt7.19□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 YPQ2YDR352W 954 nt7.18□□□□□ -1.26
RPN9Q04062 YPL067CYPL067C 597 nt7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.4 ms