Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2IP63279 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2IP63279 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBE2IP63279 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2IP63279 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UBE2IP63279 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
UBE2IP63279 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
UBE2IP63279 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UBE2IP63279 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UBE2IP63279 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms