Protein–RNA interactions for Protein: P62979

RPS27A, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27AP62979 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RPS27AP62979 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPS27AP62979 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RPS27AP62979 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms