Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SNRPD1P62314 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SNRPD1P62314 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SNRPD1P62314 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNRPD1P62314 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms