Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNAP25P60880 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP25P60880 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SNAP25P60880 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SNAP25P60880 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNAP25P60880 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms