Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME5P56597 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NME5P56597 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME5P56597 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME5P56597 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME5P56597 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME5P56597 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME5P56597 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME5P56597 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NME5P56597 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME5P56597 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NME5P56597 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME5P56597 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME5P56597 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NME5P56597 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME5P56597 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NME5P56597 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NME5P56597 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME5P56597 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME5P56597 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME5P56597 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME5P56597 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME5P56597 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME5P56597 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NME5P56597 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME5P56597 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME5P56597 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME5P56597 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME5P56597 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NME5P56597 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME5P56597 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME5P56597 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NME5P56597 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NME5P56597 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME5P56597 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME5P56597 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME5P56597 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME5P56597 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME5P56597 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NME5P56597 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NME5P56597 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NME5P56597 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME5P56597 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NME5P56597 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NME5P56597 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME5P56597 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NME5P56597 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME5P56597 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NME5P56597 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME5P56597 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME5P56597 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NME5P56597 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NME5P56597 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME5P56597 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME5P56597 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME5P56597 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME5P56597 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NME5P56597 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NME5P56597 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME5P56597 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME5P56597 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NME5P56597 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NME5P56597 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME5P56597 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME5P56597 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME5P56597 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME5P56597 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME5P56597 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NME5P56597 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME5P56597 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME5P56597 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NME5P56597 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME5P56597 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NME5P56597 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME5P56597 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME5P56597 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME5P56597 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NME5P56597 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME5P56597 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NME5P56597 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME5P56597 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NME5P56597 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME5P56597 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME5P56597 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME5P56597 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME5P56597 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NME5P56597 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME5P56597 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME5P56597 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME5P56597 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME5P56597 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME5P56597 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NME5P56597 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NME5P56597 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME5P56597 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME5P56597 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NME5P56597 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
NME5P56597 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME5P56597 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NME5P56597 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms